首当其冲的就是消费者对于爱尔眼科治疗“水平低下”的投诉。据媒体报道，德州庆云的马先生在爱尔眼科做完白内障手术之后一直存在“眼睛看不清”的情况，“现在我的左眼是一点也看不见了，严重影响生活，导致现在生活不能自理，找不到能解决问题的地方，真是走投无路了，好好的家庭让爱尔眼科这个白内障手术给搅的乱七八糟，苦恼的很啊”， 马先生针对此问题一直坚持在与爱尔眼科方面沟通并谋求解决，但收到的确是医院相关负责人强势的回应。
根据马先生向媒体的反映，他曾多次与济南爱尔眼科方面沟通，但遇到的只是推诿和“要么去起诉”的答复，马先生本人曾先后辗转北京、青岛多家知名医院治疗，这些医院纷纷对马先生在爱尔眼科所做的手术提出质疑。
无独有偶，曾经还有一篇《济南一女孩做倒睫毛手术后扎眼，事发爱尔眼科医院》的报道引出了不小的纠纷，“孩子在济南爱尔眼科医院做了倒睫手术后恢复不好,还有疤痕增生,现在都不想上学了”，该事件在媒体报道之后也是不了了之。
石家庄的一位消费者也遇到了类似的问题，他在网络投诉平台称自己在爱尔眼科医院做了2次近视手术，但是存在“虚影严重，远近都不太清楚，看小的东西模糊，戴眼镜也矫正不了”的情况，在消费者向主治医生反馈之后收到的确是“不耐烦”的应付，最终该情况也没有得到有效解决。“奉劝大家手术有风险，尽量选择公立医院”，这是该网友最终无奈留下的一句话。
可见爱尔眼科在医疗、手术水平上存在的问题并不是“个例”，有数量庞大的消费者都曾在网络、媒体对其治疗水平提出过质疑，这不由地让人怀疑爱尔眼科在医疗水平建设上是否像它宣传的那样靠谱。
除此之外，爱尔眼科还曾被山东省质量技术监督局通报“定配眼镜不合格”、被深圳市卫计委通报“医疗质量评价与监测结果不合格”，并被要求整改。
另外投诉比较集中的还有对于爱尔眼科“牟利至上”的质疑。一位消费者曾经在2018年12月10日参加了爱尔眼科“团购减800”的促销活动，但当消费者缴纳全款进行完手术之后，医院方面却拒绝退还减免的800元，而且还拒不承认此前做出的减免承诺。
“我作为一个消费者，在当时信任医院的情况下，并没有做任何防备，也拿不出医院承诺的证据，多次向爱尔眼科总部进行投诉，但是一直也没有结果，爱尔眼科总部应该对分院负有管理职责，分院做出如此损害消费者权益的事情也不予管理”，这名消费者同样无可奈何地选择在网络投诉平台上对爱尔眼科进行了“声讨”。
此外，还有大量消费者投诉爱尔眼科“坑骗患者乱收费”，以“免费手术”“手术减免”等名义吸引消费者前来就诊，却最终在引导消费者来院检查或缴纳相关款项之后拒不认账。
已经成为私营眼科诊疗行业龙头的爱尔眼科显然在快速扩张的同时未能做好其医疗水平、服务能力的同步提升，虽然它的经营业绩越来越好，但消费者质疑和投诉居高不下的情况下，能否解决消费者的这些疑虑才是它未来应该考量的重中之重。
